レイヤーを統合します。 『レイヤー』→『表示レイヤーを結合』 その後 『イメージ』→『色調補正』 →『トーンカーブ』 で、いろいろ値をいじって 好みの濃さや明るさにします。
線画レイヤーを別に保存していた 画像から引っ張ってきました。 乗算にしてボカシを軽くかけて 『イメージ』→『色調補正』 →『色相・彩度』 で色味を変えてみてます。